Біологічний моніторинг водного середовища – довгострокові систематичні спостереження і контроль за водним середовищем, об’єктами, процесами та явищами, що відбуваються в ньому, аналіз та оцінка їх стану з метою раціонального природокористування, прогнозування можливих змін і розроблення науково обґрунтованих рекомендацій для прийняття управлінських рішень щодо дотримання вимог екологічної та техногенної безпеки на локальному, регіональному і глобальному рівнях та забезпечення екологічного благополуччя навколишнього природного середовища.